“Chuyến tàu huyền thoại” tái hiện lại câu chuyện lịch sử cận đại diễn ra ngay trên dòng sông qua các chương: "Hạ thủy", "Cập bến", "Ra khơi", "Dậy sóng" và "Vươn xa". Các chương được kể theo trình tự thời gian, kết nối với nhau, giúp khán giả dễ dàng hình dung trọn vẹn câu chuyện.