Tại các vị trí bãi bồi, khu bán ngập nước sẽ được lắp đặt các bè nổi trồng cây thuỷ sinh, đoạn trước khu nhà thờ thuộc Giáo xứ Thủ Thiêm cho đến nóc hầm Thủ Thiêm với độ dài 200 m sẽ sử dụng rào chắn công trình kết hợp trồng tre, trúc, tạo tường xanh dọc bờ sông.