Không đồng ý với mức án 3 năm tù giam, Nguyễn Khắc Thủy kháng cáo và được giảm nhẹ hình phạt xuống 18 tháng tù treo cho tội “Dâm ô với trẻ em”. Bản án này cho tới nay vẫn gây nhiều tranh cãi và bức xúc.