Việc nộp lệ phí xét tuyển trên hệ thống của Bộ Giáo dục và Đào tạo chỉ áp dụng với phương thức sử dụng kết quả thi tốt nghiệp THPT. Các nguyện vọng đăng ký theo phương thức xét tuyển khác phải nộp lệ phí theo quy định của trường đại học.