Ngoài những ưu điểm vượt trội trong việc giáo dục toàn diện cho trẻ, phương pháp Montessori cũng có không ít khuyết điểm đang tồn đọng.
Không có ai sinh ra đã hoàn hảo, mọi người đều có những điểm yếu cần khắc phục và điểm mạnh cần phát huy.